Σύμφωνα με όσα έχουν γίνει γνωστά βρέθηκε στο αυτοκίνητό του, έχοντας δεχθεί σφαίρα στο κεφάλι.
O 39χρονος Παγκόσμιος Πρωταθλητής διακομίσθηκε άμεσα στο νοσοκομείο «Λα Παζ» της Μαδρίτης, όπου άφησε την τελευταία του πνοή μια ημέρα αργότερα. Η αστυνομία έχει ξεκινήσει έρευνες για να διαλευκάνει τον θάνατο του Ισπανού.
Ο Μπαγιεστέρος ήταν ιδιαίτερα αγαπητός και θεωρείτο ο κορυφαίος στο άθλημα του, μολονότι δεν είχε καταφέρει να λάβει μέρος σε Ολυμπιακούς Αγώνες. Το 2017 ανέβηκε στην κορυφή του κόσμου στην πρακτική σκοποβολή, ενώ στέφθηκε Πρωταθλητής Ευρώπης, το 2013 και το 2016. Επίσης, εργαζόταν ως αστυνομικός στην Policia Nacional.
